洞元湖の小島に祀られている水神様のうち一番新しいものが平成３年９月ということですが、平成３年は上流の奈良俣ダムが完成した年ですね。ダムの試験湛水が終了し運用に入ったのが平成３年６月（管理開始は同年４月）です。
以下は奈良俣ダムのサイトのアドレスです。ここの「奈良俣ダムが出来るまで」の項目に年表があります。
http://www.water.go.jp/kanto/numata/04_naramata/naramata.html

私の想像としては洞元トンネルは狭く老朽化も進んでいたため奈良俣ダムを建設する際に新たに現在の県道を建設したというところではないでしょうか。

> 私の想像としては洞元トンネルは狭く老朽化も進んでいたため奈良俣ダムを建設する際に新たに現在の県道を建設したというところではないでしょうか。

なるほど、仰るとおりですね。
この可能性は十分ある気がします。
少なくとも、洞元トンネルでは奈良俣ダムの工事車両進入路にはなり得なかったでしょう。

水神様から県道に戻る途中に山側の路肩からお湯が湧き出ていました。
指で触ったら結構な高温でしたよ。
でもあんな場所を下手に掘ったら何げに大変な事になるんでしょうね。
真上には同門あるし、下はダム湖だし。